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在污水處理活性污泥法中起主要作用的是活性污泥，污水處理活性污泥是由具有活性的微生物、微生物自身氧化的殘留物、吸附在污水處理活性污泥上不能為生物所降解的有機(jī)物和無機(jī)物組成，其中微生物是污水處理活性污泥的主要組成部分。

活性污泥微生物又是由細(xì)菌、真菌、原生動(dòng)物、后生動(dòng)物等多種微生物群體相結(jié)合所組成的一個(gè)生態(tài)系。

細(xì)菌是活性污泥在組成和凈化功能上的中心，是微生物的最主要成分，污水中有機(jī)物的性質(zhì)決定那些種屬的細(xì)菌占優(yōu)勢(shì)，含蛋白質(zhì)的污水有利于產(chǎn)堿桿菌屬和芽孢桿菌屬，而醣類污水或烴類污水則有利于假單孢菌屬。在一定的能量水平（即細(xì)菌的活動(dòng)能力）下，大部分細(xì)菌構(gòu)成了污水處理活性污泥的絮凝體，并形成菌膠團(tuán)，具有良好的自身凝聚和沉淀性能。

在污水處理活性污泥法處理過程中，凈化污水的和主要承擔(dān)者是細(xì)菌，其次出現(xiàn)原生動(dòng)物，是細(xì)菌的首次捕食者，繼之出現(xiàn)后生動(dòng)物，是細(xì)菌的第二次捕食者。